正享受短暂假期的公安九课少校草薙素子（坂本真绫 配音）突然接到巴特（松田健一郎 配音）的报告，西之内某处大厦遭受恐怖分子袭击，政府高官和商业巨擎被人杀害。在草薙的指挥下，九课的石川、波玛、帕兹、巴特等人通力合作，将恐怖分子彻底制服，但草薙在行动中意外受到神秘病毒感染。在西之内恐怖袭击的同时，远郊的水坝发生爆炸案。新滨县刑警陀古萨（新垣樽助 配音）传唤水坝管理企业负责人沙特博士，对方是来自饱经战火的卡森共和国的卡尔迪斯人。受警方高层施压，陀古萨没有得到任何有用信息。另一方面，草薙一方得知恐怖分子的真实身份，正是卡尔迪斯的游击队组织。两起案件意外联系在一起，其背后隐藏怎样的真相？
本片根据士郎正宗的原作改编，为攻壳机动队前传“ARISE”的第三部。
游佐浩二 诹访部顺一 东山奈央 落合弘治 大原沙耶香 羽多野涉 钉宫理惠 中村悠一 谷山纪章 平野绫 白石凉子 户松遥 野上尤加奈 楠大典 森巧治 小松史法 坪井智浩 里卓哉 小山刚志 金光宣明 箭内仁 峰畅也
竹达彩奈 阿澄佳奈 井口裕香 仪武祐子 茅野爱衣 寿美菜子 东山奈央 内田彩 飯塚麻結 葉月絵理乃 大原沙耶香 福井裕佳梨 宫本佳那子 广桥凉 间岛淳司 古川登志夫 平野文 绿川光 中田让治
铃村健一 森川智之 樱井孝宏 伊藤步 诹访部顺一 藤原启治 楠大典 浪川大辅 丰口惠美 青木麻由子 佐藤银平 大塚芳忠 奥田启人 伊丸冈笃 桐井大介 宝龟克寿 野泽那智 藤冈弘